Protein: Những lưu ý hữu ích về cấu trúc của Protein

Đọc bài viết này để có được thông tin về cấu trúc của protein! Tìm hiểu về Wool a-Keratin, Cytochrom c, Hemoglobin, Immunoglobin G, Ribulose bisphosphate carboxylase, v.v.

//houseofpain.com/wp-content/uploads/2013/05/Proteins.jpg

(1) Len a-Keratin:

(i) Nó là một protein dạng sợi được tạo thành từ chuỗi xoắn ốc; P-xếp nếp và hình thành cấu trúc xoắn ba collagen.

(ii) Cấu trúc thứ cấp của len α-keratin là sợi xoắn tay phải.

(iii) Ba chuỗi xoắn ốc như vậy tạo thành một cuộn dây tay trái gọi là protofibril được ổn định bằng liên kết ngang liên kết disulphide.

(iv) Protofibrils cuộn vào cáp giống như các sợi nhỏ có đường kính 8nm.

(v) Hàng trăm fibril micro được nhúng vào là ma trận protein vô định hình tạo thành một fibril vĩ mô

(vi) Nhiều sợi fibrils cùng nhau tạo thành một sợi len.

(vii) Khi α-keratin tiếp xúc với nhiệt ẩm và bị kéo dài, nó chuyển thành-keratin.

Các liên kết hydro ổn định cấu trúc xoắn ốc bị phá vỡ và kết quả là tấm xếp nếp song song kéo dài.

(2) Cytochrom c:

(i) Cytochrom c là protein hình cầu nhỏ, ổn định và có màu.

(ii) Nguyên tử sắt đơn trong phân tử cytochrom c xen kẽ giữa trạng thái oxy hóa Fe II và Fe III.

(iii) Cyt c có dư lượng axit amin 104-111, 35 trong số đó được phát hiện là bất biến từ loài này sang loài khác.

(3) Huyết sắc tố (Hình 48.11):

(i) Đây là protein vận chuyển của RBC.

(ii) Sắt heme được liên kết với dư lượng histidine ở một bên của mặt phẳng heme.

(iii) Về quá trình oxy hóa, sắt được phối tử với oxy ở phía đối diện của heme trong một túi trên bề mặt của phân tử hemoglobin.

(iv) Sắt Heme vẫn ở trạng thái Fe II trong quá trình oxy hóa và khử oxy.

(v) tetramer α _{2 2} liên kết với các phân tử 4-oxy.

(vi) Liên kết của α, -β, cặp với α ₂ -β ₂ yếu hơn bên trong chúng.

(4) Globulin miễn dịch G:

(i) Đây là protein hình cầu quan trọng nhất liên quan đến phân tử kháng thể của hệ thống miễn dịch.

(ii) Đó là protein huyết thanh kết hợp với kháng nguyên.

(iii) Cấu trúc bậc bốn của I _g G được tạo thành từ 4 chuỗi polypeptide hai là chuỗi 'nhẹ' với khoảng 215 dư lượng axit amin và hai là 'chuỗi nặng' của 500 dư lượng axit amin.

(iv) 4 chuỗi được liên kết bởi các cầu nối disulfide dưới dạng 12 miền. (Hình 48.12).

(v) Khớp của phân tử hình chữ Y cung cấp sự linh hoạt sao cho hai vị trí kết hợp, nằm ở mỗi nhánh của 'Y', liên kết kháng nguyên, không phải cách nhau một khoảng cố định.

(vi) Có hai vị trí nhận diện kháng nguyên, mạng lưới chuỗi kháng nguyên kháng thể sẽ được hình thành khi kháng thể phản ứng với kháng nguyên có nhiều hơn một vị trí được kháng thể công nhận.

(5) Ribulose bisphosphate carboxylase (RUB1SCO):

(i) Đây là protein quan trọng nhất trong thực vật phản ứng xúc tác của ribulose 1, 5, bisphosphate với CO ₂ để tạo ra hai phân tử 3 phosphoglycerate trong phản ứng cố định CO ₂ . RUBISCO có cấu trúc bậc bốn với 8 protein dư nhỏ, 100 axit amin và 8 protom dư axit amin lớn 500.

Polypeptide trong cơ thể chúng ta được gấp lại thành các cấu trúc 3D phức tạp. Cấu trúc 3D của Iysozyme đã được giải mã vào năm 1965. Nó được tạo thành từ 129 axit amin theo thứ tự tuyến tính và được nối với nhau bằng các cầu nối disulphide để tạo thành cấu trúc 3D.

Cấu trúc chính của nó đọc là (NH ₂ ) KVFGRCELAAAMKRHGLDNYR GYSLGNWVCAAKF

Mô hình tuyến tính của phân tử (Hình 48.13) là một số không đều. Nếu các chuỗi bên bị tước đi và đường đi của đường trục liên kết peptide được rút ra, một số vùng protein được sắp xếp theo mô hình lặp lại. Nó hiển thị cả mẫu a-helix và p-sheet (Hình 48, 14).

Ở vùng a-helix, chuỗi xoắn quanh một vòng xoắn ốc trong khi ở (vùng 3 tờ, polypeptide chạy song song với nhau. Trong cấu trúc bậc ba có thể có các rãnh, khe hở và lồi lên trên bề mặt protein nơi các chuỗi bên axit amin cụ thể định vị để hình thành trang web liên kết các phối tử và phản ứng xúc tác.

Trong peaceodulins (protein liên kết canxi), chuỗi đơn được tổ chức thành hai miền, chỉ được nối bởi một chuỗi chuỗi polypeptide. Hai miền rất giống nhau và có thể được bắt nguồn từ sự sao chép gen (Hình 48, 15).

Protein kích hoạt dị hóa (CAP) của E. coli liên kết với các chuỗi cơ sở cụ thể trên RNA polymerase hỗ trợ DNA để liên kết với các chất xúc tiến của nó và bắt đầu phiên mã lac Operon. Một trong những lĩnh vực của CAP có công việc ràng buộc cAMP và một lĩnh vực khác nhận ra các chuỗi DNA bằng cách sử dụng mô-đun xoắn xoắn. Một trong những vòng xoắn này phù hợp với rãnh chính của DNA nơi nó có thể tạo ra sự tương tác cụ thể với các cạnh lộ ra của các bazơ.

Lực lượng đúc hình dạng của protein:

Liên kết hydro:

Hydrogen có hóa trị là một và hình thành liên kết cộng hóa trị đơn với các nguyên tử khác. Tuy nhiên, nếu nguyên tử đó là oxy, nitơ và lưu huỳnh thì nó có thể là một nhà tài trợ và chia sẻ hydro của nó với oxy, nitơ và lưu huỳnh thứ hai (người chấp nhận): Người cho hoặc người nhận phải ở trong một khoảng cách cố định với nhau (0, 3nm khoảng cách), với hydro trên một đường thẳng giữa chúng. Trong một chuỗi xoắn, nguyên tử nitơ trong liên kết peptide chia sẻ hydro của nó với oxy của liên kết peptide bốn phía trước nó trong chuỗi polypeptide.

Sự tương tác tĩnh điện:

Nếu dư lượng axit amin dương hoặc âm được chôn sâu trong protein, nơi không thể tương tác với nước, thì chúng sẽ thu hút lẫn nhau và sẽ rất khó để xé chúng ra. Một liên kết tĩnh điện như vậy bên trong protein được gọi là cầu muối.

Các nhóm cực như nhóm hydroxyl và amide là lưỡng cực: chúng có thừa electron trên một nguyên tử và thiếu hụt bù ở nguyên tử kia. Các điện tích một phần của lưỡng cực sẽ bị hút vào các lưỡng cực khác và các ion được sạc đầy.

Lực lượng của Van der Wall:

Đây là những tương tác phạm vi gần tương đối yếu giữa các nguyên tử. Những hình thức này rất quan trọng trong nội thất của protein - và màng và trong liên kết cụ thể của phối tử với vị trí liên kết của nó.

Tương tác kỵ nước:

Một polypeptide có dư lượng kỵ nước và kỵ nước sẽ tự động áp dụng một cấu hình trong đó dư lượng kỵ nước không tiếp xúc với nước, bằng cách ngồi trong một lớp lipid kép hoặc bằng cách sử dụng và hình dạng hình cầu trong đó dư lượng kỵ nước ẩn trong trung tâm của protein.

Liên kết disulphide:

Protein ngoài tế bào thường có liên kết disulphide giữa dư lượng cystein cụ thể. Chúng có xu hướng khóa các phân tử vào cấu tạo của nó. Rất ít protein chứa liên kết disulphide. Nhưng những thứ này ổn định hơn.